| 250 | 湖山水庫水域生態食物網模式之建構 | 1,000,000 | 特生-李麗華助理研究員 | 2009-01-01~2009-12-31 | |
| 240 | 清水溪水域生物棲地需求研究 | 3,000,000 | 特生-葉明峰助理研究員 | 2009-01-01~2009-12-31 | |
| 230 | 清水溪指物種生活史研究 | 2,100,000 | 特生-張世倉助理研究員 | 2009-01-01~2009-12-31 | |
| 210 | 清水溪及梅林溪河川生態系變遷監測 | 2,700,000 | 特生-陳榮宗助理研究員 | 2009-01-01~2009-12-31 | |