調節水源流量
溪流量大致可分為暴雨流量及基流量，而其最高流量稱為洪峰流量；為增加可利用之水量，應設法減低洪峰流量及增加基流量時間，以達成季節上之流量調節。再者集水區之增加溪流量及多雨地區之防治洪氾，則屬地區上之流量調節，可由適當之集水區經營方式達成；如集水區治理及增加森林植生之覆蓋地表等。
確保水源品質
影響河川與水庫水質之主要因素為浮懸物、化學成份、酸鹼度及溫度等，其污染來源可分為人為污染與天然污染兩種，此與集水區上游之土地利用開發及溪流量有關，故適當之森林經營與水土保持措施，均能達成改善河川與水庫水質之效果。
減少水庫淤積
大型水庫因其所需經費龐大，興建頗為不易；且由於台灣地質鬆軟極易崩落，土壤遇豪雨即隨水而下，水庫一旦遭受泥砂淤積，則影響其有效壽命，蓄水及防洪效果亦形減少。此外，泥砂對於河流下游危害亦烈，諸如堵塞河口迫使河流改道，以及溢流氾濫而摧毀房舍、道路、農田、人民生命等；故上游集水區之防砂治理工作，更是刻不容緩。
自然生態環境保育
集水區土地受到人為開發後，動植物之生存逐漸受到威脅，其數量日漸減少，甚或整個種群全部消失。動植物也是集水區重要的資源，為維持集水區之永續利用及維護生物多樣性，集水區之治理亦涵蓋生態保育工作之落實，以及自然生態工法之推動。