寶二水庫大壩為中央不透水心層分區滾壓式土壩，壩高61公尺，壩頂長345公尺，壩頂標高154公尺，上游側為1：3斜面上有拋石護坡；下游側為1：2.5斜面上有植草護坡，且每8公尺高有3公尺寬平台用以緩和坡度及將坡面分塊(避免坡面整體滑動)，另設有縱向溝及橫向溝以收集雨水避免沖刷邊坡。大壩總填方量為221萬立方公尺，主要料源取自水庫淹沒區內土方，一來符合經濟效益，減少運費成本，二來可增加水庫容量，增加運轉效能。