爬蟲類
曾文水庫調查共記錄到9科23種爬蟲類，保育類有2種，為第三級其他應予保育野生動物雨傘節及龜殼花，特有種有斯文豪氏攀蜥、臺灣草蜥、蓬萊草蜥及臺灣滑蜥4種。
爬蟲類的優勢物種為疣尾蝎虎、斯文豪氏攀蜥、印度蜓蜥、臺灣草蜥及麗紋石龍子等。在水池環境可發現斑龜及紅耳泥龜；草生地容易發現草蜥活動或休息；麗紋石龍子、臺灣滑蜥與印度蜓蜥主要在森林邊緣的地被層活動；樹木上可發現攀蜥、茶斑蛇、赤尾青竹絲等活動；疣尾蝎虎主要於夜間在人工建築上發現；夜間於馬路上偶可見到紅斑蛇、雨傘節及龜殼花。爬蟲類出現在馬路可能是為了從白日陽光曝曬溫度升高的地表獲取熱能，亦可能是棲地受到切割而須穿越馬路到另一邊的棲地，這也造成道路致死的課題。
目 | 科 | 學名 | 中文名 | 特有性 | 保育級 |
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龜鱉目 | 地龜科 | Mauremys sinensis | 斑龜 |
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龜鱉目 | 澤龜科 | Trachemys scripta elegans | 巴西龜 |
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有鱗目 | 飛蜥科 | Japalura swinhonis | 斯文豪氏攀蜥 | ◎ |
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有鱗目 | 壁虎科 | Gekko hokouensis | 鉛山壁虎 |
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有鱗目 | 壁虎科 | Hemidactylus frenatus | 疣尾蝎虎 |
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有鱗目 | 正蜥科 | Takydromus formosanus | 台灣草蜥 | ◎ |
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有鱗目 | 正蜥科 | Takydromus kuehnei kuehnei | 古氏草蜥 |
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有鱗目 | 正蜥科 | Takydromus stejnegeri | 蓬萊草蜥 | ◎ |
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有鱗目 | 石龍子科 | Eutropis longicaudata | 長尾南蜥 |
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有鱗目 | 石龍子科 | Eutropis multifasciata | 多線南蜥 |
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有鱗目 | 石龍子科 | Plestiodon elegans | 麗紋石龍子 |
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有鱗目 | 石龍子科 | Scincella formosensis | 臺灣滑蜥 | ◎ |
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有鱗目 | 石龍子科 | Sphenomorphus indicus | 印度蜓蜥 |
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有鱗目 | 黃頷蛇科 | Boiga kraepelini | 大頭蛇 |
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有鱗目 | 黃頷蛇科 | Cyclophiops major | 青蛇 |
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有鱗目 | 黃頷蛇科 | Dinodon rufozonatum rufozonatum | 紅斑蛇 |
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有鱗目 | 黃頷蛇科 | Lycodon ruhstrati ruhstrati | 白梅花 |
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有鱗目 | 黃頷蛇科 | Oligodon formosanus | 赤背松柏根 |
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有鱗目 | 黃頷蛇科 | Psammodynastes pulverulentus | 茶斑蛇 |
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有鱗目 | 黃頷蛇科 | Zaocys dhumnades oshimai | 過山刀 |
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有鱗目 | 蝙蝠蛇科 | Bungarus multicinctus multicinctus | 雨傘節 |
| III |
有鱗目 | 蝮蛇科 | Protobothrops mucrosquamatus | 龜殼花 |
| III |
有鱗目 | 蝮蛇科 | Trimeresurus stejnegeri | 赤尾青竹絲 |
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