兩棲類
曾文水庫庫區調查到6科21種的兩棲類，沒有保育類紀錄，特有種記錄到4種，分別為盤古蟾蜍、褐樹蛙、面天樹蛙及莫氏樹蛙。
庫區數量佔優勢的兩棲類有面天樹蛙、黑蒙西氏小雨蛙、小雨蛙、澤蛙、莫氏樹蛙、拉都希氏赤蛙、白頷樹蛙及巴氏小雨蛙等，在秋天繁殖季梭德氏赤蛙數量亦多。在分布上盤古蟾蜍、澤蛙、巴氏小雨蛙、小雨蛙、黑蒙西氏小雨蛙、拉都希氏赤蛙、日本樹蛙、面天樹蛙、白頷樹蛙和莫氏樹蛙等種類的分布較廣，庫區周邊各樣區均有紀錄。在棲地偏好方面，溪澗、河川周邊易發現盤古蟾蜍、褐樹蛙、日本樹蛙、斯文豪氏赤蛙和梭德氏赤蛙等偏好流動水域的種類；草澤和池塘的種類較豐富，包括黑眶蟾蜍、澤蛙、虎皮蛙、巴氏小雨蛙、小雨蛙、黑蒙西氏小雨蛙、貢德氏赤蛙、拉都希氏赤蛙、白頷樹蛙和莫氏樹蛙等偏好靜水域的種類；暫時性積水和溝渠等環境則會有澤蛙、福建大頭蛙、巴氏小雨蛙、小雨蛙、黑蒙西氏小雨蛙、史丹吉氏小雨蛙、拉都希氏赤蛙、日本樹蛙、面天樹蛙、白頷樹蛙和莫氏樹蛙等種類；面天樹蛙和艾氏樹蛙常於樹林內活動；中國樹蟾常棲息於農墾地、果園和其周邊的樹林環境。
調查時在庫區周邊道路上偶可發現被來往車輛壓死的兩棲類，道路致死的種類主要有拉都希氏赤蛙、梭德氏赤蛙和日本樹蛙3種，其中拉都希氏赤蛙和日本樹蛙均會於路旁暫時性積水或溝渠活動，因此較可能被來往車輛壓死；梭德氏赤蛙則是於秋季會大量從樹林移動至溪流繁殖，若道路切割其移動路徑，即可能於短時間內發生大量的道路致死情形。
目 | 科 | 學名 | 中文名 | 特有種 | 保育種 |
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無尾目 | 蟾蜍科 | Bufo bankorensis | 盤古蟾蜍 | ◎ |
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無尾目 | 蟾蜍科 | Duttaphrynus melanostictus | 黑眶蟾蜍 |
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無尾目 | 樹蟾科 | Hyla chinensis | 中國樹蟾 |
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無尾目 | 叉舌蛙科 | Fejervarya limnocharis | 澤蛙 |
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無尾目 | 叉舌蛙科 | Hoplobatrachus rugulosus | 虎皮蛙 |
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無尾目 | 叉舌蛙科 | Limnonectes fujianensis | 福建大頭蛙 |
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無尾目 | 狹口蛙科 | Microhyla butleri | 巴氏小雨蛙 |
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無尾目 | 狹口蛙科 | Microhyla fissipes | 小雨蛙 |
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無尾目 | 狹口蛙科 | Microhyla heymonsi | 黑蒙西氏小雨蛙 |
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無尾目 | 狹口蛙科 | Micryletta steinegeri | 史丹吉氏小雨蛙 |
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無尾目 | 赤蛙科 | Babina adenopleura | 腹斑蛙 |
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無尾目 | 赤蛙科 | Hylarana guentheri | 貢德氏赤蛙 |
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無尾目 | 赤蛙科 | Hylarana latouchii | 拉都希氏赤蛙 |
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無尾目 | 赤蛙科 | Odorrana swinhoana | 斯文豪氏赤蛙 |
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無尾目 | 赤蛙科 | Rana sauteri | 梭德氏赤蛙 |
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無尾目 | 樹蛙科 | Buergeria japonica | 日本樹蛙 |
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無尾目 | 樹蛙科 | Buergeria robusta | 褐樹蛙 | ◎ |
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無尾目 | 樹蛙科 | Kurixalus eiffingeri | 艾氏樹蛙 |
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無尾目 | 樹蛙科 | Kurixalus idiootocus | 面天樹蛙 | ◎ |
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無尾目 | 樹蛙科 | Polypedates braueri | 白頷樹蛙 |
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無尾目 | 樹蛙科 | Rhacophorus moltrechti | 莫氏樹蛙 | ◎ |
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