補充水是當雨水貯水槽的在水位低時，需用來補充系統的第二個用水來源，亦即通常指為自來水或井水/地下水或山泉水等來源。其主要目的是確保在雨水收集入貯水槽但沒有足夠的容量設置或收集量等情況下，雨水的補充會遭間斷影響生活用雜用水時，需進行第二水源補充。

仍然建議雨水進行初期雨水過濾後，收集的雨水能再進行淨水及其它消毒處理，但這仍須視收集雨水使用在哪方面，以及經費之編列預算而修訂處理方式。

污染物造成雨水水源水質欠佳的情況將依屋頂的類型，環境、收集空間的材料、發展的類型、和維護方法而改變。但在大部分的情況下，屋頂的雨水比停車場/空地/道路的收集水「較乾淨」，所需處理過程要求也較簡易。

適當的設計能使雨水長時間儲存。若儲存之雨水可能長時間存放不使用，則需注意收集區域如屋頂、停車場等其流入之沉澱物的量和污染物負荷能最少，並確實做好初期雨水分流、例常的貯留桶槽底部排汙處理，以及排氣和病媒控制等。

可以。建議在貯水槽內即已設置的觀測井或進出口，以便能進入清潔。