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本計畫以彰化芳苑海岸為研究對象，為二年計畫。第一年是針對彰化芳苑海岸潮間帶進行調查、分析、評估等整體性生態工程之規劃研究。第二年度主要工作項目為持續第一年度之利用動植物生態與水質及底質等調查與分析，建立生態指標、生物棲地定性、定量模式，以及經由水質和底質相關性研究、水生植物復育研究與沙洲、人工潮溝及人工潟湖可行性研究，與當地居民訪談，進行實質生態工程與景觀工法之分析與規劃。 彰化芳苑海岸，其地勢平坦、潮差大，潮間帶寬可達3公里以上，北側永興海堤現有養殖蚵架，南側芳苑市區海堤段為茂盛之紅樹林區。水質底質受到養殖廢水汙染，生物多樣性低落，但全區海岸生物數量極為豐富，若能妥為經營，將可成為優良之生態保護區；現有海岸設施係以防止天然災害為目的，除了永興海堤以外，其餘並未考量對生態、親水和景觀之影響，因此有重新規劃之必要。 水質底質遭受到污染的問題，將使用生態工程去除，以工程技術構築人類與自然互利共存的生態系，其手法包括利用潮間帶生態系統、水生植物、海水交換等，在淨化後以復育指標生物為目標，在提高生物多樣性的前提下，發展賞鳥觀光及近岸漁業經濟價值。 海岸設施之規劃重建當以海堤為優先，利用生態工程中緩坡、多孔隙及塊石潛沒化三種手法來達到生態、親水和防災三個目標，另再配合陸域植生部份，將海岸陸側營造為富有生態景觀的區域，再與潮間帶生態工程結合，成為以永續經營為目標的整合型海岸工程。