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本計畫依據經濟部水利署第八河川局93年「卑南溪治理規劃檢討報告」成果、95年度「卑南溪水系河道大斷面測量計畫」成果、95年度「卑南溪水系河道大斷面測量計畫」之成果及96年度「卑南溪河川防護工法安全性檢討評估及改善對策研擬計畫（1/2）」進行97年度「卑南溪河川防護工法安全性檢討評估及改善對策研擬計畫（2/2）」河川水理演算，並配合既設防洪構造物現狀調查結果，檢討斷面6～斷面96，共58段堤防、護岸等護坡工、基礎工及護腳工之安全評估及提出其改善對策。 本計畫自卑南溪河口臺東大橋到上游池上大橋共埋設9支自河床面而下6公尺深之沖刷磚，以實際調查河床在不同洪水之沖刷深度。經現地調查結果與原設計圖說（CAD圖）顯示比較護坡正常基腳沒有裸露現象，部份護腳工處消波塊有沖刷、傾斜情形，約略分布於水理2維計算中流速較大的地方且與力學初步推估吻合（力學推估上因資料不足上多數參數均為預估值及平均值，其準確性尚須確認，建議作為參考依據。）；多數斷面之保護工消波塊有傾斜情形，然尚不至於危及堤防本身，可見保護工仍具相當的保護功能。 新興堤防柳枝工及木梢沈床自93年12月底完工至今已臻三年，且柳枝工已鬱鬱成林。經94年、95年兩年之洪水，二年來持續追蹤詳細觀察，比較水利署雨量站記錄資料與之第八河川局所分析暴雨頻率結果，93年底的豪大雨及94年8月中旬的珊瑚颱風，均未對堤防其造成沖刷破壞，顯見對洪水有消能作用，故可確保護岸安全。96年八月連續三個颱風(帕布、梧提、聖帕)後進行柳枝工根系之開挖，而觀察並瞭解根系之發展良好，且接近水邊之水柳之根纏繞著柳枝工之塊石，已形成根固定塊石之作用。 經本計畫95年已完成之柳枝工、木梢沈床護岸生態調查，本次魚類多了鯰之種類，而兩棲類日本樹蛙，白頜樹蛙、盤古蟾蜍及鱉均在該河段出現，鳥類中番鵑、環頸雉、灰頭鷦鶯、白頭翁、紅鳩、棕三趾鶁均已在本段河邊林出現，並發現其巢穴。顯現本段生態工法已初具成效。