本年度溪流生態系統研究則針對湖山水庫相關溪流之經營管理進行研擬，期能為未來湖山水庫完工後之溪流生態保育方式進行準備，以作為日後水庫經營管理之參考；另外本年度另增設清水溪生態池設置的可行性評估，以期能對清水溪之溪流生態系有所助益。103年度之研究計畫項目如下：
◎清水溪生態池設置可行性評估之研究◎湖山水庫相關溪流生態系經營管理之研擬及檢討