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為加強水庫集水區保育工作，依據行政院核定「水庫集水區保育綱要」規定，各水庫管理機關(構)應彙整研提「水庫集水區保育實施計畫」報核，本局曾文、牡丹、阿公店水庫集水區保育實施計畫(108-111年)，業已報核執行，而下一階段「水庫集水區保育實施計畫」(112-116年)，本局擬將彙整集水區相關單位資料提出報核。屆時將每年檢核各水庫集水區保育實施計畫執行成效，並依滾動式檢討方式逐年修正各年度執行目標值。另為鼓勵居民愛鄉、愛土之價值觀，結合在地志工或在地居民蒐集調查水庫集水區水環境資料或建置必要之監測設施，自主配合進行環境巡守或偕同政府單位進行環境監測等方式，以實際行動激發民眾對於水環境之關注及責任感，藉由防災保育社區之方式統合辦理，強化公民參與之效果，落實水庫集水區保育治理實施計畫之精神。