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南化水庫位於台南市南化區曾文溪支流的後堀溪中上游，以阿里山山脈與曾文水庫相隔。主要結構物包括大壩、溢洪道、導水隧道及排水工等。主壩於民國82 年11 月完工，水庫容量達1 億5,400 萬立方公尺，為台灣公共給水單標的最大之水庫，主要供給台南及高雄地區。為增加南化水庫供水能力，於民國88 年完成旗山溪越域引水設施注入旗山溪水源，爾後南化水庫經常保持滿盈狀態，有效提升水庫供水效益。惟南化水庫由於近年水庫淤積嚴重，據民國97 年辦理淤積測量結果顯示庫前淤積面已達EL.143m，民國98 年莫拉克颱風過後，壩前淤積更達EL.150.8m，嚴重影響水庫蓄水功能。爰此，為確保水庫運轉順暢並蓄清排渾，延長水庫壽命及基於永續利用之原則，乃規劃進行增設防淤隧道工程設施，經濟部水利署南區水資源局(以下簡稱本局)奉經濟部水利署100 年1 月20 日召開之「水利署代辦南化水庫防洪防淤工程計畫設計及施工監造」會議中決議，銜命代辦執行「南化水庫防淤隧道工程計畫」，以減緩水庫淤積問題，解除水庫取水營運之危機。