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為了維護居民生命財產安全及發展經濟，多年來興設許水利構造物，無形中卻也影響河川環境生態。為降低工程的負面影響，水利署近幾年來努力尋找生物與環境間的關係，即是希望透過此一關係瞭解工程設置或相關管理措施對生物所造成的影響。過去曾嘗試辦理魚類適合度曲線的相關研究，以流速、水深及底床粒徑等工程人員孰悉的參數，透過調查、統計建立魚類適合度(喜好)的關係曲線，水利工程人員僅需透過水理模式即可瞭解工程設施對水理條件的影響進而推求魚類適合度的變化，相關曲線目前已有相當廣泛的應用。惟過去僅針對頭前溪、烏溪、楠梓仙溪等建置魚類適合度曲線，未能含括多數的臺灣原生魚類，且相同魚類在不同溪流亦有不同的曲線，因此本計畫將擴大辦理，並增加魚類生活史的探討，瞭解原生魚種生殖周期與對於自然棲地的選擇及偏好，以補充水理參數外的相關資訊，作為水利工程規劃及河川經營管理亟需的基本生物參數。除將相關成果建置資料庫以方便管理使用外，也將研擬魚類棲地適合度調查技術作業手冊，使調查方法與努力量標準化，讓後續的調查能有一定的品質要求與依據。